Biobanking Basis-Set

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Das Modul Biobanking Basis-Set dient der Dokumentation der Beschaffenheit von Proben aus dem Basis-Set. Das Basis-Set besteht aus EDTA-Plasma, Serum, Citrat-Plasma, Buffy Coat und Urin.
Die Verarbeitung und Lagerung des Materials ist gemäß DZHK-SOP-B-02 durchzuführen.
 

Anzahl gefüllter Aliquot-Gefäße

Serum

  Feldname: basis_numaliquotserumcount
  Anmerkung im CRF: Anzahl gefüllter Serum-Gefäße [300µl]
  Datentyp: Maximal 2-stellige Ganzzahl

EDTA-Plasma

  Feldname: basis_numaliquotedtacount
  Anmerkung im CRF: Anzahl gefüllter EDTA-Gefäße [300µl]
  Datentyp: Maximal 2-stellige Ganzzahl

Citrat-Plasma

  Feldname: basis_numaliquotcitratcount
  Anmerkung im CRF: Anzahl gefüllter Citrat-Gefäße [300µl]
  Datentyp: Maximal 2-stellige Ganzzahl

Urin

  Feldname: basis_numaliquoturincount
  Anmerkung im CRF: Anzahl gefüllter Urin-Gefäße [300µl]
  Datentyp: Maximal 2-stellige Ganzzahl

Buffy Coat

  Feldname: basis_numaliquotzellcount
  Anmerkung im CRF: Anzahl gefüllter Buffy Coat-Gefäße [Datentyp: Maximal 2-stellige Ganzzahl

  Abbildung: Anzahl Aliquots nach Materialart

Blut- und Urinprobe

Blutentnahme

  Feldname: basis_source
  Anmerkung im CRF: Blutentnahme
  Datentyp: Zeichenkette mit folgenden Ausprägungen
    venös
    arteriell
    unbekannt
    nicht erhoben

  Abbildung: Anzahl Datensätze nach Blutentnahme

Position bei Blutentnahme

  Feldname: basis_position
  Anmerkung im CRF: Position bei Blutentnahme
  Datentyp: Zeichenkette mit folgenden Ausprägungen
    sitzend
    liegend
    unbekannt
    nicht erhoben

  Abbildung: Anzahl Datensätze nach Position bei Blutentnahme

Dauer der Position vor Entnahme

  Feldname: basis_durationpositionnum
  Anmerkung im CRF: Dauer der Position des Patienten/Probanden vor Entnahme
  Datentyp: Maximal 2-stellige Ganzzahl und Maximum bei 60

  Feldname: basis_durationposition
  Datentyp: Ankreuzfeld mit Ja oder Nein

Abstand zur letzten Nahrungsaufnahme

  Feldname: basis_nahrabstand
  Anmerkung im CRF: Abstand zur letzten Nahrungsaufnahme
  Datentyp: Zeichenkette mit folgenden Ausprägungen
    = 8 Std.
    unbekannt
    nicht erhoben

  Abbildung: Anzahl Datensätze nach Abstand zur letzten Nahrungsaufnahme
  Feldname: basis_abstand
  Anmerkung im CRF: Wenn bekannt, bitte die Gesamtstunden angeben
  Datentyp: Maximal 2-stellige Ganzzahl

Ernährung parenteral

  Feldname: basis_parental
  Anmerkung im CRF: Ernährung parenteral
  Datentyp: Zeichenkette mit folgenden Ausprägungen
    ja
    nein
    unbekannt
    nicht erhoben

  Abbildung: Anzahl Datensätze nach parenteraler Ernährung

Menstruation bei Uringewinnung

  Feldname: basis_menstruation
  Anmerkung im CRF: Menstruation bei Uringewinnung (bei Frauen)
  Datentyp: Zeichenkette mit folgenden Ausprägungen
    ja
    nein
    unbekannt
    nicht erhoben

  Abbildung: Anzahl Datensätze nach Menstruation

Prozessschritte

Zeitpunkt der Blutentnahme

  Feldname: basis_dtsampletaking
  Anmerkung im CRF: Zeitpunkt der Blutentnahme
  Datentyp: Zeitstempel mit Jahr, Monat, Tag, Stunde und Minute

Zeitpunkt der Urinabgabe

  Feldname: basis_dturintaking
  Anmerkung im CRF: Zeitpunkt der Urinabgabe (Klinik)
  Datentyp: Zeitstempel mit Jahr, Monat, Tag, Stunde und Minute

Zeitpunkt Eingang im Labor

  Feldname: basis_labarrivaldatetime
  Anmerkung im CRF: Zeitpunkt Eingang im Labor
  Datentyp: Zeitstempel mit Jahr, Monat, Tag, Stunde und Minute

Zeitpunkt Eingang im Labor (Urin)

  Feldname: basis_labarrivalurindate
  Anmerkung im CRF: Wenn Urin-Eingang unterschiedlich von Blut:
  Datentyp: Zeitstempel mit Jahr, Monat, Tag, Stunde und Minute

Ende der Zentrifugation

  Feldname: basis_endofcentrifugation
  Anmerkung im CRF: Ende der Zentrifugation
  Datentyp: Zeitstempel mit Jahr, Monat, Tag, Stunde und Minute

Ende der Zentrifugation (Urin)

  Feldname: basis_endofcentriurin
  Anmerkung im CRF: Wenn Urin-Eingang unterschiedlich von Blut, hier bitte Zeiten für Urin eintragen:
  Datentyp: Zeitstempel mit Jahr, Monat, Tag, Stunde und Minute

Zeitpunkt Einfrieren aller Aliquots

  Feldname: basis_freezingdate
  Anmerkung im CRF: Zeitpunkt Einfrieren aller Aliquots bei -80°C (Serum, EDTA-Plasma, Citrat-Plasma, Urin, Buffy Coat)
  Datentyp: Zeitstempel mit Jahr, Monat, Tag, Stunde und Minute

Probebeschaffenheit (Blut)

Unauffällig

  Feldname: basis_stateordinary
  Anmerkung im CRF: Ist die Probenbeschaffenheit unauffällig?
  Datentyp: Zeichenkette mit folgenden Ausprägungen
    ja
    nein
    unbekannt
    nicht erhoben

Lipämisch

  Feldname: basis_statelipaemic
  Anmerkung im CRF: Ist die Probenbeschaffenheit lipämisch?
  Datentyp: Zeichenkette mit folgenden Ausprägungen
    ja
    nein
    unbekannt
    nicht erhoben

Ikterisch

  Feldname: basis_stateikteric
  Anmerkung im CRF: Ist die Probenbeschaffenheit ikterisch?
  Datentyp: Zeichenkette mit folgenden Ausprägungen
    ja
    nein
    unbekannt
    nicht erhoben

Hämolytisch

  Feldname: basis_statehaemolytic
  Anmerkung im CRF: Ist die Probenbeschaffenheit hämolytisch?
  Datentyp: Zeichenkette mit folgenden Ausprägungen
    ja
    nein
    unbekannt
    nicht erhoben

  Abbildung: Anzahl Blut-Aliquots nach Probenbeschaffenheit

Probenbeschaffenheit (Urin)

Unauffällig

  Feldname: basis_stateurinordinary
  Anmerkung im CRF: Ist die Probenbeschaffenheit unauffällig?
  Datentyp: Zeichenkette mit folgenden Ausprägungen
    ja
    nein
    unbekannt
    nicht erhoben

Trüb

  Feldname: basis_stateurinopaque
  Anmerkung im CRF: Ist die Probenbeschaffenheit trüb?
  Datentyp: Zeichenkette mit folgenden Ausprägungen
    ja
    nein
    unbekannt
    nicht erhoben

Blutig

  Feldname: basis_stateurinbloody
  Anmerkung im CRF: Ist die Probenbeschaffenheit blutig?
  Datentyp: Zeichenkette mit folgenden Ausprägungen
    ja
    nein
    unbekannt
    nicht erhoben

  Abbildung: Anzahl Urin-Aliquots nach Probenbeschaffenheit

Kommentare

Kommentar (allgemein)

  Feldname: basis_pbscomment
  Datentyp: Freitext

Kommentar (Aliquots)

  Feldname: basis_numfullaliquotzelpko
  Anmerkung im CRF: Kommentar
  Datentyp: Freitext